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Buen día Guillermo.
Sí se puede.
Saludos.
PD: he creado hace poco un Grupo especializado en Pentaho Data Integration, estaría bueno que te unieses e hicieses las consultas ahí.
Puedes llamar un procedure a través del paso "Scripting" -> "Ejecutar script SQL", rellenando los campos de nombre y conexión y colocando bajo "Programa SQL a ejecutar": call miProcedure
Saludos.
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